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    qPCR軟件報(bào)錯(cuò)了?別慌,這篇文章會給你答案!

    在運(yùn)行qPCR實(shí)驗(yàn)或分析數(shù)據(jù)時(shí),有時(shí)候會遇到軟件報(bào)錯(cuò),小編在這里列舉了Applied BiosystemsTM 品牌儀器軟件的常見報(bào)錯(cuò),分析了可能的原因和解決辦法,如果您正在使用我們的儀器,希望本文能給您提供一些解決軟件報(bào)錯(cuò)問題的思路。


    一、通用報(bào)錯(cuò)(多款機(jī)型軟件均可能出現(xiàn))
    1. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報(bào)錯(cuò):java.lang.IIIegalArgumentException: One of the raw spectra is null。點(diǎn)擊OK接受后,擴(kuò)增曲線是空白(如圖stepone plus軟件)。
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    問題分析:

    可能是單次數(shù)據(jù)異常,導(dǎo)致校正文件丟失。在軟件上點(diǎn)擊Analysis  > override calibration > Use another calibration file 下選擇同儀器相同類型實(shí)驗(yàn)文件做校正 ,重新分析后可以恢復(fù)正常數(shù)據(jù)。出現(xiàn)該報(bào)錯(cuò)的原因可能是雙擊了start run, 或者分析/保存數(shù)據(jù)過程被中斷,例如分析/保存過程中關(guān)閉軟件或拔出U盤。

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    2. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報(bào)錯(cuò):Analysis cannot proceed: not enough sample definded(如圖stepone plus軟件,此報(bào)錯(cuò)僅限stepone,stepone plus,7300 plus,7500 v2.0以上版本軟件)。

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    問題分析:

    plate setup步驟未給樣品孔設(shè)置sample信息,設(shè)置好sample信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復(fù)正常。

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    3. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報(bào)錯(cuò):Analysis cannot proceed: not enough targets definded(如圖stepone plus軟件,此報(bào)錯(cuò)僅限stepone,stepone plus,7300 plus,7500 v2.0以上版本軟件)。

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    問題分析:

    plate setup步驟未給樣品孔設(shè)置target信息,設(shè)置好target信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復(fù)正常。

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    4. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報(bào)錯(cuò):Analysis failed due to: GExSession doesn't exist in context。點(diǎn)擊OK  接受后,擴(kuò)增曲線是空白(如圖stepone plus軟件)。

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    問題分析:

    擴(kuò)增循環(huán)階段未采集信號,需要打開信號收集標(biāo)識。

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    5. 在多重反應(yīng)程序設(shè)置中,給樣品孔添加ROX作為reportor 的探針時(shí),報(bào)錯(cuò):Dye "ROX" already used in passive reference(如圖Q5軟件)。

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    問題分析:

    儀器默認(rèn)passive reference選擇ROX作為參比熒光,如果實(shí)驗(yàn)中ROX是作為探針的報(bào)告基團(tuán),則需要將passive reference改成None,之后就可以在target設(shè)置中選擇ROX作為探針了。


    6. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報(bào)錯(cuò):The selected file cannot be opened, cannot open the file because file contents are not recognized(如圖Q5軟件)。

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    問題分析:

    可能的原因包括: 

    1. 通過導(dǎo)入文件(import plate setup)在實(shí)驗(yàn)中添加了重復(fù)的樣本,使用了相同的sample name,建議編輯樣品名稱時(shí)不要使用相同的sample name 命名樣品。

    2. 實(shí)驗(yàn)名稱包含不合要求的字符,例如空格,括號等,建議實(shí)驗(yàn)名稱不要使用不符要求的字符。

    3. 文件受損,數(shù)據(jù)不完整,建議儀器運(yùn)行過程中不要操作軟件。

    4. 拷貝數(shù)據(jù)的U盤有故障,導(dǎo)致拷貝數(shù)據(jù)不完整,建議更換U盤重新拷貝數(shù)據(jù)。


    二、7500報(bào)錯(cuò)

    1. 運(yùn)行程序時(shí)報(bào)錯(cuò):1404  Hold duration too short for read。

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    問題分析:

    數(shù)據(jù)采集時(shí)間太短,PCR循環(huán)階段data collection step 時(shí)間設(shè)置不小于31秒,melt curve 階段data collection step請勿修改。


    2. 運(yùn)行程序時(shí)報(bào)錯(cuò):Java Platform SE Binary has stopped working,實(shí)驗(yàn)中斷。

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    問題分析:

    如果通過直接雙擊已保存的edt模板文件去運(yùn)行實(shí)驗(yàn)程序,可能會出現(xiàn)報(bào)錯(cuò)。建議先打開7500軟件,通過New Experiment > From Template導(dǎo)入edt文件進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。


    3. 點(diǎn)擊start run時(shí)報(bào)錯(cuò)"The instrument type for the experiment is not compatible with the connected instrument"。

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    問題分析:

    實(shí)驗(yàn)中選擇的儀器類型與實(shí)際使用的儀器不符,需要到Setup界面重新修改為正確的儀器類型。

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    4. 程序設(shè)置報(bào)黃色提醒 "number of data collection points is not valid"

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    問題分析:

    運(yùn)行程序設(shè)置了多個(gè)信號采集點(diǎn),定量實(shí)驗(yàn)中只能設(shè)置一個(gè)信號采集點(diǎn),可以設(shè)置在cycling stage 。


    5. eds文件導(dǎo)入PTS軟件,報(bào)錯(cuò)"cannot import any experiment file(s) because of the following error(s): "

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    問題分析:

    使用7500 v2.4版本軟件產(chǎn)生的數(shù)據(jù)與PTS軟件不兼容,可以將eds數(shù)據(jù)先用7500 v2.3的軟件打開,分析后保存,然后再導(dǎo)入PTS軟件。


    三、Q3/5報(bào)錯(cuò)

    1. 數(shù)據(jù)打開后擴(kuò)增曲線是空白,點(diǎn)擊Analyze分析后報(bào)錯(cuò):The analysis cannot proceed because the experiment is missing required plate setup information. Go to 'Define' and 'Assign' page to creat and assign targets and samples. 點(diǎn)擊OK接受后,擴(kuò)增曲線仍是空白。

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    問題分析:

    plate setup步驟未給樣品孔設(shè)置target或者sample name信息,設(shè)置好target或者sample name信息后重新分析,數(shù)據(jù)可以恢復(fù)正常。

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    2. 運(yùn)行PTS實(shí)驗(yàn)報(bào)錯(cuò):Star run validation: The filter set has not been selected for following target: ROX(x4-m4)。

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    問題分析:

    含melt curve的實(shí)驗(yàn)程序中,軟件默認(rèn)melt curve filter只選擇X1M1,PTS實(shí)驗(yàn)需要從軟件進(jìn)入Method-action-optical filter settings, 在melt curve filter選項(xiàng)中將x4m4選中(Q5也可以嘗試x1m3)。

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    3. 打開數(shù)據(jù)分析軟件報(bào)錯(cuò):Analysis failed due to insufficient data。

    問題分析:

    1.4.3之前版本的軟件有bug, 部分染料法實(shí)驗(yàn)結(jié)果擴(kuò)增曲線是空白,解決方法是在analysis setting 點(diǎn)擊apply,即可恢復(fù)正常顯示。1.4.3之后的軟件版本無此問題。

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    四、stepone/stepone plus 報(bào)錯(cuò)

    1. 開始運(yùn)行實(shí)驗(yàn)前報(bào)錯(cuò):You must first download experiment"XXX"before you can start another run on  this instrument.  

    問題分析:

    上次運(yùn)行實(shí)驗(yàn)沒有正常傳輸?shù)诫娔X端,需先將上次實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)下載到電腦然后才能開始運(yùn)行。在軟件上點(diǎn)擊Instrument > Download Experiment from Instrument下載數(shù)據(jù)后,即可重新開始運(yùn)行試驗(yàn)。

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    2. 打開數(shù)據(jù)點(diǎn)擊analyze分析軟件報(bào)錯(cuò):Cannot calculate Pure Dye Matrix。

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    問題分析:

    該報(bào)錯(cuò)指示運(yùn)行結(jié)果文件中有原始數(shù)據(jù)丟失,可能是實(shí)驗(yàn)程序沒有運(yùn)行結(jié)束或在運(yùn)行過程中被終止所導(dǎo)致。例如客戶將反應(yīng)程序最后一步設(shè)置為infinite holding stage,最后通過點(diǎn)擊STOP結(jié)束程序容易導(dǎo)致該問題。針對這樣的數(shù)據(jù),可以聯(lián)系技術(shù)支持尋求幫助。


    3. 查看熔解曲線時(shí)出現(xiàn)黃色報(bào)錯(cuò):No derivative curve for all selected wells due to excessive noise in fluorescence data.

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    問題分析:

    熔解曲線程序設(shè)置錯(cuò)誤,如下圖中數(shù)據(jù)誤刪掉了60度的步驟,設(shè)成了95度升溫到95.3度。建議使用SYBR Green染料法做實(shí)驗(yàn)時(shí),不要修改熔解曲線步驟,使用儀器默認(rèn)程序即可。

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